Quantitative Trait Loci Controlling Oil Sorption in Kenaf: Mapping and Implications
本研究は、DArTSeq 技術を用いてケナフの油吸着能を制御する 3 つの有意な QTL と 8 つの仮説的 QTL を同定し、油流出事故の効率的な浄化に向けたマーカー支援選抜による品種改良の可能性を示しました。
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molecular biology
376 件の論文
ATG5 regulates autophagy-apoptosis-ER stress dysregulation in steroid-induced osteonecrosis of the femoral head (SONFH) pathogenesis
ATG5 はステロイド性大腿骨頭壊死症（SONFH）において、PERK 経路を介した過剰なオートファジーと小胞体ストレスを誘導しアポトーシスを引き起こす主要な因子であり、ATG5 の抑制がその病態を改善する新たな治療戦略となり得ることを示した。
ATAD2 BRD mediates liquid-liquid phase separation of ATAD2 to promote histone acetylation
本論文は、ATAD2 の BRD 領域が液 - 液相分離を介してヒストンアセチル化を促進し、クロマチンリモデリングやがん関連遺伝子の発現上昇を引き起こす新たなメカニズムを解明したものである。
Discovery, characterisation and optimisation of bicyclic peptide inhibitors that disarm Staphylococcus aureus a-hemolysin
本研究は、ファージディスプレイ技術を用いて発見・最適化されたビサイクリックペプチドが、黄色ブドウ球菌の主要な病原性因子であるα-溶血素に結合し、その細胞毒性を阻害する新たな抗病原性治療戦略として有望であることを示した。
Hunting for Helminths: short- and long-read shotgun metagenomics for parasite detection in faecal samples
この論文は、糞便サンプルからの土壌伝染性線虫の検出において、ミトコンドリア配列のマッピングが短リードシーケンシングと組み合わせた際、感度と特異性の面で最も効果的な手法であることを示し、感染強度が低い場合や長リードシーケンシングの利用には注意が必要であると結論付けています。
Topological Regulation of the Mammalian Genome by Positive DNA Supercoiling
本研究は、GapR 解析システムを用いて哺乳類ゲノムにおける正の DNA 超ねじれを包括的にマッピングし、転写や R ループ、コヒーシン、コンデンシンなどの因子が遺伝子発現制御やゲノム構造、エピジェネティックな記憶に正の超ねじれを介してどのように関与するかを解明しました。
Evolution of Origin Sequence and Recognition for Licensing of Eukaryotic DNA Replication
本論文は、出芽酵母*S. cerevisiae*と異なり配列特異性が低下していると考えられる真核生物の複製起点において、*Yarrowia lipolytica*のORC-Cdc6複合体が構造的な可塑性を介して多様な配列を認識するメカニズムを解明し、真核生物における複製起点の進化と認識機構の多様性を明らかにしたものである。
A lipoprotein partner for the Escherichia coli outer membrane protein TolC
本論文は、脂質修飾を持たない大腸菌の TolC が、その脂質モイエティを模倣して TolC と結合する脂質タンパク質 YbjP をパートナーとして見出し、両者の複合体のクライオ電子顕微鏡構造を解明したことを報告しています。
Lysosomal Expansion Compartments Mediate Zinc and Copper Homeostasis in Caenorhabditis elegans
本論文は、線虫（C. elegans）の腸細胞において、亜鉛だけでなく銅やマンガンなどの過剰金属もリソソームの拡張区画の体積増加を伴うリモデル化によって取り込まれ、金属毒性の防止に寄与していることを明らかにしたものである。
Mind the crack: Crack-arrest holes and soft-suspension support integration in cryo-lamella preparation for improved resistance to crack formation, fracture and deformation
本論文は、クライオ電子顕微鏡用ラムラの破損を防ぐため、亀裂を遮断する穿孔と、柔軟なリング状スプリングによる懸垂支持という2つの改良手法を導入し、ラムラの機械的強度と耐性を大幅に向上させたことを報告しています。
The human DEAD-box protein DDX3X regulates host and viral mRNA translation during Sendai Virus infection
この論文は、パラリンクリップ法を用いて解析した結果、ヒトのDEAD-box RNA ヘリカーゼである DDX3X がセナイウイルス感染中に宿主 mRNA（特に IFNB1）の翻訳を促進する新たな抗ウイルスメカニズムを担う一方で、ウイルス RNA 自体には直接的な影響を与えないことを明らかにしたものである。
Regulation and Function of the HPV16 CircE7 RNA
本研究は、m6A 修飾が HPV16 の circE7 RNA 形成と E6*I スプライシングを逆相関的に制御し、これがウイルス複製と角化細胞の形質転換能のバランスに不可欠であることを明らかにした。
Establishing MS2-MCP-based single-molecule RNA visualization in Schizosaccharomyces pombe
本研究は、MS2-MCP システムを用いた単分子 RNA 可視化技術の確立が長らく難しかった分裂酵母（Schizosaccharomyces pombe）において、MCP タンパク質の発現と局在を最適化し、高光安定性の StayGold 蛍光タンパク質を融合させることで、初めてこの技術を成功させ、分裂酵母における RNA 動態の定量的解析を可能にしたことを報告しています。
In-house produced MarathonRT comparison to uMRT and Induro in tRNA sequencing library preparation
本研究では、tRNA 配列ライブラリー調製の課題を解決し、市販酵素と同等の性能を持ちながら大幅なコスト削減を実現する、インハウス生産型の MarathonRT 酵素の簡易精製法と、それに伴う迅速な tRNA 抽出法の開発を報告しています。
Mechanism of circZNF827-mediated transcriptional repression during neuronal differentiation
本研究は、神経分化中に circZNF827 が hnRNPL/K と複合体を形成して H3K27me3 依存性の転写抑制を介して NGFR 遺伝子などを制御し、二次的な応答を通じて神経分化を促進する分子機構を解明したものである。
Optimized tRNA Structure-seq reveals robust tRNA secondary structures in S. cerevisiae under mild stress conditions
本研究は、天然の tRNA 修飾と tRNA 特異的な自由エネルギーパラメータを組み込んだ最適化された tRNA Structure-seq 解析法を開発し、S. cerevisiae の tRNA 二次構造予測精度を 94% まで向上させるとともに、生理学的なストレス条件下でも tRNA が安定したクローバー葉型構造を維持することを明らかにしました。
Preconceptional immunomodulation partially corrects pregnancy associated abnormalities induced by endometriosis in a mice model, with a normalization of transcriptional alteration observed in the developing fetal maternal interface at the single cell level.
マウスモデルを用いた本研究は、子宮内膜症が妊娠初期の着床不全や流産リスクを高めるメカニズムを単一細胞レベルで解明し、妊娠前の免疫調節介入により胎盤形成の転写異常や妊娠合併症を部分的に改善できる可能性を示しました。
Analysis of genes co-evolved with Igf2bp RNA-Binding Proteins provides insights into post-transcriptional regulatory networks
本論文は、神経発達とがんにおいて重要な役割を果たす Igf2bp RNA 結合タンパク質ファミリーの進化、機能、およびがん化における再活性化をレビューし、共進化解析を通じて神経発生とがんの両方に関与する転写後調節ネットワークの新たなモデルを提案するものである。
MethylAmp One-step isothermal amplification with preservation of DNA methylation patterns
本研究は、DNA メチル化パターンを維持したまま増幅を可能にするため、DNMT1 の耐熱性を向上させることなく 42°C で両酵素反応を共存させる一工程等温増幅法「MethylAmp」を開発し、エピジェネティック解析の精度向上に貢献したことを報告しています。
PARP inhibitor synthetic lethality reveals homologous recombination sub-pathway architecture
本論文は、CRISPR スクリーニングを用いて PARP 阻害剤処理後の相同組換え（HR）サブ経路の遺伝的相互作用を体系的にマッピングし、RAD54L や RAD51AP1 などの因子の役割を解明するとともに、TOP3A が HR 経路の選択バランスを調節し、経路間の依存関係を決定づける重要な因子であることを明らかにしました。